Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vbp1P61759 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms