Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abce1P61222 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abce1P61222 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abce1P61222 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abce1P61222 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms