Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chp1P61022 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chp1P61022 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chp1P61022 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chp1P61022 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms