Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms