Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scarf2P59222 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms