Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Csrnp3P59055 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms