Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rhbdl3P58873 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl3P58873 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms