Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf16P58334 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf16P58334 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf16P58334 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms