Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf2P58021 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tm9sf2P58021 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms