Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NcstnP57716 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NcstnP57716 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms