Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pdcd5P56812 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdcd5P56812 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms