Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gp1bbP56400 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gp1bbP56400 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms