Protein–RNA interactions for Protein: P55288

Cdh11, Cadherin-11, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh11P55288 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdh11P55288 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdh11P55288 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh11P55288 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh11P55288 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh11P55288 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh11P55288 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh11P55288 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh11P55288 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh11P55288 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh11P55288 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh11P55288 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh11P55288 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh11P55288 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh11P55288 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh11P55288 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdh11P55288 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms