Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd3P55096 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms