Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ephb3P54754 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms