Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacnb3P54285 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacnb3P54285 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms