Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RabggtbP53612 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RabggtbP53612 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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