Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Map3k1P53349 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Map3k1P53349 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Map3k1P53349 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms