Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApodP51910 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ApodP51910 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApodP51910 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApodP51910 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApodP51910 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApodP51910 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApodP51910 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApodP51910 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApodP51910 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApodP51910 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ApodP51910 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ApodP51910 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ApodP51910 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ApodP51910 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ApodP51910 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ApodP51910 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ApodP51910 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ApodP51910 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApodP51910 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApodP51910 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApodP51910 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApodP51910 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApodP51910 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApodP51910 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApodP51910 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApodP51910 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApodP51910 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ApodP51910 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApodP51910 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApodP51910 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApodP51910 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ApodP51910 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApodP51910 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApodP51910 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApodP51910 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApodP51910 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApodP51910 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApodP51910 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApodP51910 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApodP51910 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApodP51910 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ApodP51910 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApodP51910 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApodP51910 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ApodP51910 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ApodP51910 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms