Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LumP51885 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LumP51885 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LumP51885 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LumP51885 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LumP51885 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LumP51885 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LumP51885 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LumP51885 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LumP51885 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LumP51885 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LumP51885 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LumP51885 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LumP51885 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LumP51885 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LumP51885 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LumP51885 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LumP51885 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LumP51885 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LumP51885 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LumP51885 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LumP51885 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LumP51885 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LumP51885 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LumP51885 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LumP51885 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LumP51885 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LumP51885 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LumP51885 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LumP51885 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LumP51885 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LumP51885 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LumP51885 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LumP51885 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LumP51885 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LumP51885 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LumP51885 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LumP51885 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LumP51885 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LumP51885 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms