Protein–RNA interactions for Protein: P51859

Hdgf, Hepatoma-derived growth factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdgfP51859 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdgfP51859 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdgfP51859 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdgfP51859 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdgfP51859 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HdgfP51859 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HdgfP51859 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HdgfP51859 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdgfP51859 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdgfP51859 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdgfP51859 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdgfP51859 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdgfP51859 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdgfP51859 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdgfP51859 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HdgfP51859 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdgfP51859 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdgfP51859 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdgfP51859 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdgfP51859 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms