Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RorcP51450 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RorcP51450 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RorcP51450 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RorcP51450 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RorcP51450 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RorcP51450 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RorcP51450 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RorcP51450 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RorcP51450 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RorcP51450 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RorcP51450 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RorcP51450 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RorcP51450 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RorcP51450 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RorcP51450 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RorcP51450 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RorcP51450 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RorcP51450 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RorcP51450 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RorcP51450 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RorcP51450 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RorcP51450 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms