Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa-rs12P50716 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms