Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FmodP50608 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FmodP50608 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FmodP50608 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FmodP50608 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FmodP50608 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FmodP50608 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FmodP50608 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FmodP50608 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FmodP50608 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FmodP50608 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FmodP50608 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FmodP50608 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FmodP50608 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FmodP50608 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FmodP50608 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FmodP50608 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FmodP50608 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FmodP50608 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FmodP50608 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FmodP50608 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FmodP50608 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FmodP50608 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FmodP50608 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FmodP50608 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FmodP50608 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FmodP50608 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FmodP50608 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FmodP50608 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FmodP50608 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FmodP50608 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FmodP50608 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FmodP50608 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FmodP50608 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FmodP50608 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FmodP50608 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FmodP50608 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FmodP50608 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FmodP50608 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FmodP50608 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms