Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csrp3P50462 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms