Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxc13P50207 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxc13P50207 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms