Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rbp3P49194 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbp3P49194 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms