Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnni3P48787 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms