Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx3P48759 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptx3P48759 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms