Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcd1P48410 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms