Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rfx2P48379 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rfx2P48379 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms