Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Resp18P47939 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Resp18P47939 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Resp18P47939 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Resp18P47939 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Resp18P47939 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Resp18P47939 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Resp18P47939 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms