Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf1P46099 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf1P46099 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klf1P46099 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf1P46099 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf1P46099 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf1P46099 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf1P46099 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klf1P46099 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.2 ms