Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbP41155 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbP41155 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtbP41155 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtbP41155 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtbP41155 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtbP41155 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtbP41155 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtbP41155 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtbP41155 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtbP41155 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtbP41155 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtbP41155 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtbP41155 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtbP41155 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtbP41155 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtbP41155 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LtbP41155 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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LtbP41155 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LtbP41155 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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LtbP41155 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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LtbP41155 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LtbP41155 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LtbP41155 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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