Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt4P40749 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt4P40749 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt4P40749 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms