Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chd1P40201 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd1P40201 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd1P40201 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chd1P40201 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd1P40201 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd1P40201 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd1P40201 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chd1P40201 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Chd1P40201 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd1P40201 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd1P40201 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd1P40201 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chd1P40201 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms