Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf1P39428 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf1P39428 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf1P39428 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Traf1P39428 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms