Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lig1P37913 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lig1P37913 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lig1P37913 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lig1P37913 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lig1P37913 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lig1P37913 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lig1P37913 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lig1P37913 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lig1P37913 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms