Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PpargP37238 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PpargP37238 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PpargP37238 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PpargP37238 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PpargP37238 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PpargP37238 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PpargP37238 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PpargP37238 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PpargP37238 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PpargP37238 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PpargP37238 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PpargP37238 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PpargP37238 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms