Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rfc1P35601 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rfc1P35601 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms