Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sftpa1P35242 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms