Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc5P32043 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms