Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tacr1P30548 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms