Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VtnP29788 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VtnP29788 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VtnP29788 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VtnP29788 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VtnP29788 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VtnP29788 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VtnP29788 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
VtnP29788 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VtnP29788 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VtnP29788 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VtnP29788 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VtnP29788 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms