Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HexaP29416 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HexaP29416 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HexaP29416 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HexaP29416 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HexaP29416 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HexaP29416 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HexaP29416 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HexaP29416 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HexaP29416 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HexaP29416 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HexaP29416 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HexaP29416 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HexaP29416 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HexaP29416 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HexaP29416 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HexaP29416 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HexaP29416 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HexaP29416 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HexaP29416 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HexaP29416 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HexaP29416 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HexaP29416 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HexaP29416 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HexaP29416 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HexaP29416 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HexaP29416 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HexaP29416 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HexaP29416 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HexaP29416 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HexaP29416 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HexaP29416 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HexaP29416 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HexaP29416 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HexaP29416 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HexaP29416 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HexaP29416 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms