Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprmP28828 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprmP28828 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprmP28828 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprmP28828 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprmP28828 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprmP28828 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprmP28828 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprmP28828 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprmP28828 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprmP28828 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprmP28828 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprmP28828 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprmP28828 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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