Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2-DMaP28078 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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H2-DMaP28078 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-DMaP28078 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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