Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb9P28076 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb9P28076 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms