Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpbP28033 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpbP28033 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpbP28033 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CebpbP28033 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CebpbP28033 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms