Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl3P27659 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms